Технология восстановления протеина из боенских отходов позволяет производить как смешанную муку с богатым содержанием протеина, где все виды сырья перерабатываются вместе (перья/шерсть, кровь и мягкие субпродукты (кишсырье) с ножками и лапками, копытами и т.д.), так и отдельные виды муки при использовании отдельных линий производтва: мясокостной, перьевой (шерстяной) и кровяной, а также жира. Преимущество изготовления отдельных видов муки позволяет получить конечный продукт более высокого качества, однако оно привлекательно только при переработке большого объема сырья.
Переработка отходов на оборудовании может осуществляться двумя способами: при небольших объемах сырья обычно используют производство порциями, а при больших - непрерывное (поточное) производство. На одной и той же установке возможна переработка как птицеводческих, так и свиноводческих отходов и отходов КРС, только при переработке боенского материала свиней и КРС необходимо установить предварительную дробилку для крошения сырья.